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分组摘要 摘要函数summaize()结合分组函数group_by()能够很方便地得到统计结果。 结合使用管道符号%>%,可以省却很多变量

使用jcvi进行MCscan可视化

安装 软件推荐使用pip安装,但是作为普通用户,还是选择使用conda安装 1 2 3 4 5 conda create -n jcvi python=2.7 source activate jcvi # 安装前需要确认存在bioconda和r c

R4ds-exercises-1

统计变换 What is the default geom associated with stat_summary()? How could you rewrite the previous plot to use that geom function instead of the stat function? 统计变换函数stat_summary()的默认几何对象函数是什么?如何使用几何对象

【R】饼图

使用基本的pie()函数能够直接画出饼状图 1 pie(x, labels, radius, main, col, clockwise) 简单方案 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 # Create data for the graph. x <- c(11, 30, 39, 20) labels <- c("70后&#

绘制treemap

treemap 安装 1 install.packages("treemap") 读取数据 1 contig_length <- read.table("genome_length.txt", header = FALSE, sep = '\t') 画图 1 treemap(contig_length, index = "V1", vSize = "V2", palette = "Reds", title = "Contig length of xxx genome") 指定每格的颜色与边框宽度 1 2 3 4 #添加一列作为颜色列,为每一行