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RNA-seq小考核 2019-03-11 Q1: 参考基因组及注释文件下载地址 列出人,小鼠,拟南芥的基因组序列,转录组cDNA序列,基因组注释gtf文件下载地址 Human (GRCh38.p12) ftp://ftp.ensembl.org/pub/release-95/fasta/homo_sapiens/dna/Homo_sapiens.GRCh38.dna.toplevel.fa.gz ftp://ftp.ensembl.org/pub/release-95/fasta/homo_sapiens/cdna/Homo_sapiens.GRCh38.cdna.all.fa.gz ftp://ftp.ensembl.org/pub/release-95/gtf/homo_sapiens/Homo_sapiens.GRCh38.95.gtf.gz Mouse (GRCm38.p6) ftp://ftp.ensembl.org/pub/release-95/fasta/mus_musculus/dna/Mus_musculus.GRCm38.dna.toplevel.fa.gz ftp://ftp.ensembl.org/pub/release-95/fasta/mus_musculus/cdna/Mus_musculus.GRCm38.cdna.all.fa.gz ftp://ftp.ensembl.org/pub/release-95/gtf/mus_musculus/Mus_musculus.GRCm38.95.gtf.gz Arabidopsis thaliana (TAIR10) ftp://ftp.ensemblgenomes.org/pub/plants/release-42/fasta/arabidopsis_thaliana/dna/Arabidopsis_thaliana.TAIR10.dna.toplevel.fa.gz 阅读更多
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R语言练习题 2019-03-11 初级 http://www.bio-info-trainee.com/3793.html 1. 打开 Rstudio 告诉我它的工作目录。 1 getwd() 2. 新建6个向量,基于不同的原子类型。(重点是字符串,数值,逻辑值) 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 # Character v_char <- c("www","biotrainee","com") # 阅读更多
使用SERF鉴定端粒序列 2019-03-08 端粒重复序列 端粒是染色体末端的一端核酸序列,起着保护染色体末端免于降解,防止与相邻的染色体错误融合的作用。其名称来源于希腊语 τέλος (en 阅读更多