Pilon的使用

Pilon使用read比对分析识别输入的基因组序列与reads证据之间的不一致,尝试修正基因组序列中的差错,包括: 单碱基变异 小的插入缺失 较大

PASA的安装

安装PASA 1 2 3 4 5 6 7 8 cd ~/software/ wget https://github.com/PASApipeline/PASApipeline/releases/download/pasa-v2.3.3/PASApipeline-v2.3.3.tar.gz tar zxf PASApipeline-v2.3.3.tar.gz -C ~/opt/ mv ~/opt/PASApipeline-pasa-v2.3.3 ~/opt/pasa-v2.3.3 cd ~/opt/pasa-v2.3.3 make echo '$PASAHOME=~/opt/pasa-v2.3.3/' >> ~/.bashrc source ~/.bashrc 安装perl模块 安装PASA最大的困难就在于perl模块的配置。本文参

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