在服务器安装Jupyter Notebook

安装 使用conda安装简单方便 1 2 3 conda creat -n jupyter python=3.6 source activate jupyter conda install jupyter notebook 配置 1 2 3 jupyter notebook --generate-config ##生成配置文件 jupyter notebook password ##设置jupyter密码 vi ~/.jupyter/jupyter_notebook_config.py 设置如下 1 2

自动化运行OrthoMCL

安装 1 git clone https://github.com/apetkau/orthomcl-pipeline.git Perl模块 通过cpanm安装 1 cpanm BioPerl DBD::mysql DBI Parallel::ForkManager YAML::Tiny Set::Scalar Text::Table Exception::Class Test::Most Test::Warn Test::Exception Test::Deep Moose SVG Algorithm::Combinatorics 依赖软件 OrthoMCL 或 OrthoMCL Custom (能够自定义序列识别符的修改版本) BLAST (blastall, formatdb) 注意不是

【R】改变因子的排列顺序

R中的因子存在着有序和无序两种,默认按照ASCII顺序排序。 对于无序因子 使用levels函数指定顺序,如下 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 # 创建一个错误

InterProScan的安装与使用

安装要求 64-bit Linux Perl 5 (default on most Linux distributions) Python 3 (InterProScan 5.30-69.0 onwards) Oracle’s Java JDK/JRE version 8 (InterProScan 5.17-56.0 onwards) Environment variables set $JAVA_HOME should point to the location of the JVM $JAVA_HOME/bin should be added to the $PATH 下载与安装 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 # 下载核心程序

重装mysql

重新安装mysql, 将其回复默认的配置 删除mysql 1 sudo apt-get remove --purge mysql-* 清理残留数据 1 dpkg -l |grep ^rc|awk '{print $2}' |sudo xargs dpkg -P 或者更为手动的方式,首先搜索含有mysql