Windows中R的配置

用户目录

R的用户目录在Windows系统下默认位于当前用户的Documents文件夹

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> normalizePath('~')
[1] "C:\\Users\\yourUserName\\Documents"

注意，若你使用了Onedrive，并且将文档文件夹加入了自动保护，那么当前用户的Documents文件夹将会被导向至OneDrive文件夹，导致莫名其妙的错误。建议将该功能关闭。

该文件设置R自身的一些环境变量，仅对R有效，不改变操作系统的设置。

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file.edit('~/.Renviron')

推荐在此设置R_LIBS_USER，指定R的附加包安装目录。

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R_LIBS_USER="~/R"

若该目录不存在，需要自行手动创建。

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dir.creat('~/R')

该文件其实是一个R代码文件，在R启动时，该文件会被首先执行。因此，我们可以将一些个人选项写在其中。

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file.edit('~/.Rprofile')

使用options()函数设置R运行时的一些选项，如CRAN的镜像地址

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options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/",
CRANextra = "http://www.stats.ox.ac.uk/pub/RWin"))

“我的电脑”（右键）–>“属性”–>“高级”–>“环境变量”–>“系统变量”–>PATH

其实R在安装的时候，默认会将配置写入注册表

该文件是R在Windows下独有的一个配置文件，可以直接使用文本编辑器编辑。其中配置了Windows下R界面的属性，如界面语言或字体等。

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file.path(R.home('etc'), 'Rconsole')

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language = en # 修改界面语言为英文

Windows下R的升级方式很不灵活，官方推荐的方式竟然是重新安装，手动复制附加包到新的library文件夹。

实测我们可以先卸载旧版本的R，卸载程序会保留library文件夹。然后再安装新版本R，手动指定安装目录至原路径。最后再新版本的R中运行

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update.packages(checkBuilt=TRUE, ask=FALSE)

由于之前的配置文件如.Renviron, .Rprofile等存在于用户目录下，升级过程中不受影响。