解决方案

目前找到最简便的解决方案

其他方案都依赖使用Bioperl, BioPython, BioRuby等解决方案，不够灵活

网页版解决方案，其中还有许多丰富功能，有待发现

使用方法

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python blastxml_to_tabular.py -o output.tabular -c std input.xml

其中std代表标准的12列格式，ext代表具有额外信息的25列格式

参考来源

http://seqanswers.com/forums/showthread.php?t=29799

https://www.biostars.org/p/7290/