makeblastdb-fails
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问题描述
对某个特定下载的数据库使用makeblastdb
建库时,出现No volumes were created because no sequences were found.
报错
使用环境
BLAST 2.2.28+
需要建库的fasta文件内容格式如下
|
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解决方案
删除序列名中重复的部分,删去gnl|
即可运行makeblastdb
似乎此bug在BLAST 2.2.30+版本后被修正,目前还未验证。
对某个特定下载的数据库使用makeblastdb
建库时,出现No volumes were created because no sequences were found.
报错
BLAST 2.2.28+
需要建库的fasta文件内容格式如下
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删除序列名中重复的部分,删去gnl|
即可运行makeblastdb
似乎此bug在BLAST 2.2.30+版本后被修正,目前还未验证。